Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
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Atp8b3Q6UQ17 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
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Atp8b3Q6UQ17 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Atp8b3Q6UQ17 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Atp8b3Q6UQ17 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp8b3Q6UQ17 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Atp8b3Q6UQ17 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp8b3Q6UQ17 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp8b3Q6UQ17 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp8b3Q6UQ17 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp8b3Q6UQ17 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp8b3Q6UQ17 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp8b3Q6UQ17 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp8b3Q6UQ17 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Atp8b3Q6UQ17 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp8b3Q6UQ17 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp8b3Q6UQ17 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Atp8b3Q6UQ17 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp8b3Q6UQ17 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp8b3Q6UQ17 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp8b3Q6UQ17 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp8b3Q6UQ17 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Atp8b3Q6UQ17 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp8b3Q6UQ17 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp8b3Q6UQ17 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp8b3Q6UQ17 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp8b3Q6UQ17 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp8b3Q6UQ17 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp8b3Q6UQ17 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp8b3Q6UQ17 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp8b3Q6UQ17 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp8b3Q6UQ17 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp8b3Q6UQ17 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp8b3Q6UQ17 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp8b3Q6UQ17 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp8b3Q6UQ17 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp8b3Q6UQ17 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp8b3Q6UQ17 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp8b3Q6UQ17 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Atp8b3Q6UQ17 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp8b3Q6UQ17 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms