Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Krt9Q6RHW0 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms