Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9P0

Slf2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf2Q6P9P0 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slf2Q6P9P0 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms