Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Krt77Q6IFZ6 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Krt77Q6IFZ6 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms