Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg9bQ6EBV9 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg9bQ6EBV9 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg9bQ6EBV9 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg9bQ6EBV9 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg9bQ6EBV9 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg9bQ6EBV9 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg9bQ6EBV9 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg9bQ6EBV9 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg9bQ6EBV9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Atg9bQ6EBV9 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
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Atg9bQ6EBV9 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Atg9bQ6EBV9 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
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Atg9bQ6EBV9 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Atg9bQ6EBV9 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Atg9bQ6EBV9 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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