Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC6

Tro, Tro protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,087 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TroQ6DIC6 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
TroQ6DIC6 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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