Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pram1Q6BCL1 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms