Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Pdzrn3Q69ZS0 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms