Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZJ7

Ric1, RAB6A-GEF complex partner protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ric1Q69ZJ7 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ric1Q69ZJ7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms