Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sptbn2Q68FG2 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms