Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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PtprdQ64487 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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PtprdQ64487 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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PtprdQ64487 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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PtprdQ64487 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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PtprdQ64487 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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PtprdQ64487 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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PtprdQ64487 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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PtprdQ64487 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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PtprdQ64487 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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PtprdQ64487 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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PtprdQ64487 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprdQ64487 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms