Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Taf6Q62311 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Taf6Q62311 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Taf6Q62311 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Taf6Q62311 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Taf6Q62311 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Taf6Q62311 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Taf6Q62311 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Taf6Q62311 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Taf6Q62311 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Taf6Q62311 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Taf6Q62311 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Taf6Q62311 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Taf6Q62311 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Taf6Q62311 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Taf6Q62311 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Taf6Q62311 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Taf6Q62311 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Taf6Q62311 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Taf6Q62311 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Taf6Q62311 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Taf6Q62311 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Taf6Q62311 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Taf6Q62311 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Taf6Q62311 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Taf6Q62311 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Taf6Q62311 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Taf6Q62311 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Taf6Q62311 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Taf6Q62311 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Taf6Q62311 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Taf6Q62311 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Taf6Q62311 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Taf6Q62311 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Taf6Q62311 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Taf6Q62311 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Taf6Q62311 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Taf6Q62311 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Taf6Q62311 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Taf6Q62311 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Taf6Q62311 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Taf6Q62311 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Taf6Q62311 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Taf6Q62311 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Taf6Q62311 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Taf6Q62311 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Taf6Q62311 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Taf6Q62311 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Taf6Q62311 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Taf6Q62311 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Taf6Q62311 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Taf6Q62311 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Taf6Q62311 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Taf6Q62311 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Taf6Q62311 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Taf6Q62311 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Taf6Q62311 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Taf6Q62311 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Taf6Q62311 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Taf6Q62311 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Taf6Q62311 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Taf6Q62311 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Taf6Q62311 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Taf6Q62311 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Taf6Q62311 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Taf6Q62311 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Taf6Q62311 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Taf6Q62311 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Taf6Q62311 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Taf6Q62311 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Taf6Q62311 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Taf6Q62311 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Taf6Q62311 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Taf6Q62311 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Taf6Q62311 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Taf6Q62311 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Taf6Q62311 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Taf6Q62311 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Taf6Q62311 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Taf6Q62311 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Taf6Q62311 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Taf6Q62311 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Taf6Q62311 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Taf6Q62311 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Taf6Q62311 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Taf6Q62311 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Taf6Q62311 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Taf6Q62311 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Taf6Q62311 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Taf6Q62311 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Taf6Q62311 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Taf6Q62311 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Taf6Q62311 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Taf6Q62311 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Taf6Q62311 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Taf6Q62311 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Taf6Q62311 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Taf6Q62311 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Taf6Q62311 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Taf6Q62311 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms