Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

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Length 993 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Sycp1Q62209 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Sycp1Q62209 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Sycp1Q62209 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Sycp1Q62209 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sycp1Q62209 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sycp1Q62209 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sycp1Q62209 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sycp1Q62209 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sycp1Q62209 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sycp1Q62209 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sycp1Q62209 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sycp1Q62209 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sycp1Q62209 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sycp1Q62209 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sycp1Q62209 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sycp1Q62209 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sycp1Q62209 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sycp1Q62209 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sycp1Q62209 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sycp1Q62209 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sycp1Q62209 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sycp1Q62209 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sycp1Q62209 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sycp1Q62209 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sycp1Q62209 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sycp1Q62209 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sycp1Q62209 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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