Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Rbm38Q62176 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Rbm38Q62176 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Rbm38Q62176 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Rbm38Q62176 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Rbm38Q62176 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rbm38Q62176 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Rbm38Q62176 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Rbm38Q62176 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
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Rbm38Q62176 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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Rbm38Q62176 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rbm38Q62176 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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