Protein–RNA interactions for Protein: Q61716

Ifna11, Interferon alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna11Q61716 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ifna11Q61716 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms