Protein–RNA interactions for Protein: Q61409

Pde3b, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde3bQ61409 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pde3bQ61409 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pde3bQ61409 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Pde3bQ61409 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pde3bQ61409 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pde3bQ61409 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pde3bQ61409 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pde3bQ61409 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pde3bQ61409 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pde3bQ61409 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pde3bQ61409 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pde3bQ61409 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pde3bQ61409 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde3bQ61409 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde3bQ61409 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde3bQ61409 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde3bQ61409 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde3bQ61409 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde3bQ61409 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde3bQ61409 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde3bQ61409 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde3bQ61409 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde3bQ61409 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde3bQ61409 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde3bQ61409 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde3bQ61409 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde3bQ61409 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde3bQ61409 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde3bQ61409 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde3bQ61409 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde3bQ61409 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde3bQ61409 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde3bQ61409 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde3bQ61409 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde3bQ61409 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde3bQ61409 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde3bQ61409 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde3bQ61409 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pde3bQ61409 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde3bQ61409 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde3bQ61409 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde3bQ61409 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde3bQ61409 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pde3bQ61409 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pde3bQ61409 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde3bQ61409 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde3bQ61409 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pde3bQ61409 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde3bQ61409 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde3bQ61409 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde3bQ61409 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pde3bQ61409 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde3bQ61409 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde3bQ61409 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde3bQ61409 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pde3bQ61409 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde3bQ61409 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde3bQ61409 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pde3bQ61409 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pde3bQ61409 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pde3bQ61409 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pde3bQ61409 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms