Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

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Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Slc6a4Q60857 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc6a4Q60857 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms