Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Csnk1a1-208ENSMUST00000167187 1222 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprnQ60673 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms