Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CttnQ60598 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CttnQ60598 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CttnQ60598 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CttnQ60598 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CttnQ60598 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CttnQ60598 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CttnQ60598 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CttnQ60598 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CttnQ60598 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CttnQ60598 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CttnQ60598 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms