Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Psme4Q5SSW2 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms