Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms