Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp18Q5SSI6 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms