Protein–RNA interactions for Protein: Q504M2

Pdp2, MCG53395, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdp2Q504M2 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Pdp2Q504M2 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
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Pdp2Q504M2 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Pdp2Q504M2 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Pdp2Q504M2 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Pdp2Q504M2 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Pdp2Q504M2 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Pdp2Q504M2 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Pdp2Q504M2 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdp2Q504M2 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms