Protein–RNA interactions for Protein: Q4U2R1

Herc2, E3 ubiquitin-protein ligase HERC2, mousemouse

Predictions only

Length 4,836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc2Q4U2R1 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Herc2Q4U2R1 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Herc2Q4U2R1 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Herc2Q4U2R1 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Herc2Q4U2R1 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Herc2Q4U2R1 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Herc2Q4U2R1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Herc2Q4U2R1 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Herc2Q4U2R1 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Herc2Q4U2R1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Herc2Q4U2R1 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Herc2Q4U2R1 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Herc2Q4U2R1 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Herc2Q4U2R1 Gm5507-201ENSMUST00000091897 1008 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Herc2Q4U2R1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Herc2Q4U2R1 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Herc2Q4U2R1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Herc2Q4U2R1 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Herc2Q4U2R1 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Herc2Q4U2R1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Herc2Q4U2R1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Herc2Q4U2R1 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Herc2Q4U2R1 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Herc2Q4U2R1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Herc2Q4U2R1 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Herc2Q4U2R1 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Herc2Q4U2R1 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Herc2Q4U2R1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Herc2Q4U2R1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Herc2Q4U2R1 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Herc2Q4U2R1 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Herc2Q4U2R1 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Herc2Q4U2R1 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Herc2Q4U2R1 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Herc2Q4U2R1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Kyat1-203ENSMUST00000113660 1388 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Ssty1-202ENSMUST00000186035 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Gm21454-202ENSMUST00000192204 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Gm20807-201ENSMUST00000194687 1336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Psmf1-202ENSMUST00000109869 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Herc2Q4U2R1 Gm25394-201ENSMUST00000157338 133 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
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