Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ulk4Q3V129 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ulk4Q3V129 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms