Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
E130208F15RikQ3UPV3 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms