Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Skap2Q3UND0 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Skap2Q3UND0 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms