Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tmem253Q3UNB8 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms