Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULD5

Mccc2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc2Q3ULD5 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
Mccc2Q3ULD5 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mccc2Q3ULD5 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mccc2Q3ULD5 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mccc2Q3ULD5 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mccc2Q3ULD5 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms