Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Nkx6-3Q3UHX8 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Nkx6-3Q3UHX8 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Nkx6-3Q3UHX8 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Nkx6-3Q3UHX8 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Nkx6-3Q3UHX8 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Nkx6-3Q3UHX8 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Nkx6-3Q3UHX8 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Nkx6-3Q3UHX8 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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