Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ttll12Q3UDE2 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms