Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U595 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U595 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U595 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U595 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U595 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U595 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U595 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U595 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U595 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U595 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U595 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U595 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U595 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U595 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U595 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U595 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U595 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U595 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U595 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U595 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U595 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U595 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U595 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U595 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U595 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U595 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U595 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U595 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U595 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U595 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U595 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U595 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U595 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U595 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U595 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U595 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U595 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U595 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U595 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U595 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U595 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U595 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U595 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U595 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U595 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U595 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U595 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U595 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U595 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U595 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U595 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U595 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U595 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U595 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U595 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Q3U595 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q3U595 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q3U595 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q3U595 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q3U595 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q3U595 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Q3U595 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U595 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U595 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U595 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U595 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U595 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U595 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U595 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U595 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U595 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U595 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U595 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U595 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U595 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U595 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U595 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U595 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U595 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U595 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U595 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U595 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U595 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U595 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U595 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U595 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U595 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U595 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U595 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U595 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U595 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U595 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U595 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U595 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U595 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U595 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U595 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U595 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Q3U595 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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