Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ulk3Q3U3Q1 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms