Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf40Q3U319 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rnf40Q3U319 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rnf40Q3U319 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf40Q3U319 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Rnf40Q3U319 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf40Q3U319 Gm24380-201ENSMUST00000122696 324 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf40Q3U319 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf40Q3U319 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf40Q3U319 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf40Q3U319 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf40Q3U319 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf40Q3U319 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf40Q3U319 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf40Q3U319 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf40Q3U319 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf40Q3U319 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf40Q3U319 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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