Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf149Q3U2C5 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms