Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Ctdnep1Q3TP92 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctdnep1Q3TP92 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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