Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Usp39Q3TIX9 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp39Q3TIX9 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.1 ms