Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim71Q1PSW8 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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