Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Rpusd3Q14AI6 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Rpusd3Q14AI6 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Rpusd3Q14AI6 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
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Rpusd3Q14AI6 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Rpusd3Q14AI6 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Rpusd3Q14AI6 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Rpusd3Q14AI6 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Rpusd3Q14AI6 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Rpusd3Q14AI6 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Rpusd3Q14AI6 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpusd3Q14AI6 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
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