Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

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Length 617 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VgfQ0VGU4 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VgfQ0VGU4 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms