Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnnm1Q0GA42 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms