Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
MestQ07646 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MestQ07646 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
MestQ07646 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MestQ07646 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
MestQ07646 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MestQ07646 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MestQ07646 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MestQ07646 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
MestQ07646 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MestQ07646 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
MestQ07646 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MestQ07646 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MestQ07646 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
MestQ07646 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
MestQ07646 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
MestQ07646 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MestQ07646 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MestQ07646 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MestQ07646 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MestQ07646 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MestQ07646 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MestQ07646 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
MestQ07646 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MestQ07646 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MestQ07646 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
MestQ07646 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MestQ07646 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MestQ07646 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MestQ07646 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
MestQ07646 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MestQ07646 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MestQ07646 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
MestQ07646 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
MestQ07646 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MestQ07646 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MestQ07646 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MestQ07646 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MestQ07646 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MestQ07646 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MestQ07646 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
MestQ07646 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MestQ07646 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MestQ07646 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
MestQ07646 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
MestQ07646 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MestQ07646 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MestQ07646 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MestQ07646 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
MestQ07646 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MestQ07646 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
MestQ07646 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
MestQ07646 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
MestQ07646 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MestQ07646 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
MestQ07646 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MestQ07646 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MestQ07646 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MestQ07646 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
MestQ07646 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MestQ07646 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
MestQ07646 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
MestQ07646 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MestQ07646 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MestQ07646 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MestQ07646 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
MestQ07646 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MestQ07646 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
MestQ07646 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MestQ07646 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MestQ07646 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MestQ07646 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MestQ07646 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MestQ07646 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MestQ07646 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MestQ07646 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MestQ07646 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MestQ07646 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MestQ07646 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MestQ07646 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MestQ07646 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MestQ07646 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MestQ07646 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MestQ07646 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
MestQ07646 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MestQ07646 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MestQ07646 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MestQ07646 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MestQ07646 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MestQ07646 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MestQ07646 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MestQ07646 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MestQ07646 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MestQ07646 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MestQ07646 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
MestQ07646 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MestQ07646 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MestQ07646 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
MestQ07646 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
MestQ07646 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms