Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cab39Q06138 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms