Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Sox10Q04888 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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Sox10Q04888 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Sox10Q04888 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sox10Q04888 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Sox10Q04888 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Sox10Q04888 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Sox10Q04888 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Sox10Q04888 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Sox10Q04888 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Sox10Q04888 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Sox10Q04888 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Sox10Q04888 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Sox10Q04888 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Sox10Q04888 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Sox10Q04888 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox10Q04888 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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