Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nf1Q04690 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms