Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms