Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Col1a2Q01149 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms