Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Grin2bQ01097 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Grin2bQ01097 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Grin2bQ01097 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Grin2bQ01097 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Grin2bQ01097 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Grin2bQ01097 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Grin2bQ01097 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Grin2bQ01097 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Grin2bQ01097 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Grin2bQ01097 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Grin2bQ01097 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Grin2bQ01097 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Grin2bQ01097 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Grin2bQ01097 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Grin2bQ01097 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Grin2bQ01097 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Grin2bQ01097 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Grin2bQ01097 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Grin2bQ01097 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Grin2bQ01097 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Grin2bQ01097 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Grin2bQ01097 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Grin2bQ01097 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms