Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms