Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gjb2Q00977 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms